Lebka chrání mozek, smyslové ústrojí a její obličejová část tvoří mimo jiné čelisti, skřelové kosti a žaberní oblouky. Čtyři žaberní oblouky nesou ve dvou řadách žaberní lístky (dýchání). Pátý oblouk je u kaprovitých ryb nazýván požerákovou kostí. Zde vyrůstají požerákové zuby, určené pro drcení potravy. Skřelové kosti tvoří pevnou boční ochranu žaberních oblouků. U většiny ryb překrývají celý žaberní aparát.

Kostra ploutví je s kostrou tělovou spojena mnohem volněji, než u ostatních obratlovců – tvoří samostatné soustavy pro oporu.